Theo đó, bộ dữ liệu khí tượng thủy văn bao gồm tất cả các thông tin, dữ liệu khí tượng thủy văn quy định tại Điều 29 và thông tin, dữ liệu về giám sát biến đổi khí hậu quy định tại khoản 2 Điều 34 của Luật Khí tượng thủy văn, được sắp xếp thành các bộ sau: bộ dữ liệu về quan trắc, điều tra, khảo sát khí tượng, thủy văn, hải văn, môi trường không khí và nước; bộ dữ liệu về dự báo, cảnh báo khí tượng thủy văn; bộ dữ liệu về hồ sơ kỹ thuật trạm và giấy phép dự báo, cảnh báo khí tượng thủy văn; bộ dữ liệu về biến đổi khí hậu; bộ dữ liệu nghiên cứu khoa học, chương trình, dự án về khí tượng thủy văn; bộ dữ liệu văn bản quy phạm pháp luật về khí tượng thủy văn.
Dữ liệu trước khi đưa vào cơ sở dữ liệu khí lượng thủy văn quốc gia phải được kiểm tra, chuẩn hóa theo quy chuẩn kỹ thuật về khí tượng thủy văn và tiêu chuẩn dữ liệu quốc tế, quốc gia để đảm bảo việc quản lý và trao đổi, kết nối với các cơ sở dữ liệu khác. Việc chuẩn hóa nhằm giúp cho việc tổ chức dữ liệu trong cơ sở dữ liệu một cách hiệu quả; đồng thời giảm các dữ liệu dư thừa, bảo đảm độc lập dữ liệu để giảm thiểu không gian sử dụng trong cơ sở dữ liệu và dữ liệu được lưu trữ một cách logic.
Thông tư cũng quy định rõ trách nhiệm của các cơ quan, tổ chức sử dụng nguồn vốn ngân sách nhà nước hoặc có nguồn gốc từ ngân sách nhà nước để quan trắc, điều tra, khảo sát khí tượng thủy văn và các hoạt động khí tượng thủy văn khác có trách nhiệm giao nộp thông tin, dữ liệu khí tượng thủy văn cho cơ sở dữ liệu khí tượng thủy văn quốc gia. Thông tin, dữ liệu khí tượng thủy văn giao nộp phải có nguồn gốc được cơ quan có thẩm quyền phê duyệt hoặc xác nhận tính hợp pháp và giá trị thông tin, dữ liệu.
Các Bộ, ngành, địa phương có trách nhiệm thu nhận thông tin, dữ liệu khí tượng thủy văn do cơ quan, tổ chức thuộc Bộ, ngành, địa phương thực hiện và tổ chức lưu trữ, bảo quản, sử dụng và cung cấp thông tin, dữ liệu khí tượng thủy văn cho cơ sở dữ liệu khí tượng thủy văn quốc gia.
Trung tâm Khí tượng Thủy văn quốc gia thuộc Bộ TN&MT quản lý thông tin, dữ liệu khí tượng thủy văn của quốc gia, có trách nhiệm thu nhận thông tin và tập hợp thống nhất toàn bộ dữ liệu khí tượng thủy văn do cơ quan, tổ chức thuộc Bộ Tài nguyên và Môi trường thực hiện và do các Bộ, cơ quan ngang Bộ, cơ quan trực thuộc Chính phủ, UBND cấp tỉnh cung cấp; lưu trữ, bảo quản và cung cấp thông tin, dữ liệu khí tượng thủy văn theo quy định.
Đồng thời, Trung tâm Khí tượng Thủy văn quốc gia có trách nhiệm giúp Bộ TN&MT tổ chức quản lý, vận hành và khai khác cơ sở dữ liệu khí tượng thủy văn quốc gia. Nội dung quản lý cơ sở dữ liệu khí tượng thủy văn quốc gia bao gồm các công việc: xây dựng, cập nhật, khai thác cơ sở dữ liệu khí tượng thủy văn quốc gia và thực hiện dịch vụ công trực tuyến trong lĩnh vực khí tượng thủy văn; tích hợp kết quả quan trắc, điều tra, khảo sát và các thông tin, dữ liệu có liên quan đến khí tượng thủy văn, giám sát biến đổi khí hậu do các Bộ, ngành, địa phương có liên quan cung cấp; xây dựng, trình ban hành quy định về phân quyền truy cập vào cơ sở dữ liệu khí tượng thủy văn quốc gia; quản lý việc kết nối, chia sẻ và cung cấp dữ liệu với cơ sở dữ liệu của các Bộ, ngành và địa phương.