Hoạt động của Ban Quản lý dự án đầu tư và xây dựng công trình được chuyển đổi từ Ban Quản lý dự án đầu tư xây dựng công trình Sở Địa chính – Nhà đất, được thành lập và bổ sung chức năng theo Quyết định số 7765/QĐ-UB-NCVX ngày 16/11/1995 và Quyết định số 3153/QĐ-UB ngày 29/5/2001 của Ủy ban nhân dân thành phố và quy chế tổ chức, hoạt động do Giám đốc Sở quy định.
Ban quản lý dự án đầu tư và xây dựng công trình thay mặt Giám đốc Sở làm chủ đầu tư các dự án xây dựng cơ bản của Sở và các đơn vị sự nghiệp, công ích thuộc Sở; có chức năng tổ chức triển khai, điều phối và quản lý toàn bộ các dự án về đất đai, tài nguyên nước, khoáng sản, khí tượng thủy văn và môi trường; thực hiện kiểm tra, quản lý các dự án, dịch vụ về vệ sinh môi trường.
Chi phí hoạt động của Ban Quản lý dự án đầu tư và xây dựng công trình được cấp theo kế hoạch, dự toán do Giám đốc Sở duyệt hoặc từ chi phí quản lý các công việc, chương trình do Ban thực hiện.